No presente artigo, são descritos aspectos da utilização de ferramentas da genômica funcional e abordagens úteis na análise da bactéria causadora do cancro cítrico, Xanthomonas axonopodis pv. citri, responsável por danos econômicos consideráveis para a citricultura brasileira. Com a disponibilização dos dados do genoma completo da bactéria, uma série de recursos de análise tem sido proposta para investigar fatores de sua patogenicidade e virulência, através de estratégias que englobam o estudo da expressão de seus genes e proteínas. As principais ferramentas utilizadas para o estudo dos genes da bactéria têm sido a mutagênese, a análise de expressão em tempo real (RT-qPCR), os arranjos de cDNA e a eletroforese bidimensional (2-D), algumas delas, muitas vezes, usadas em conjunto. Com isso, vários aspectos ligados à capacidade de a bactéria causar o cancro têm sido identificados, permitindo conhecer melhor como o seu material genético orienta a sua habilidade em infectar os tecidos de citros.

This report describes aspects of using a number of tools from the functional genomics as well as approachs useful for the analysis of the causal agent of the citrus canker, the bacterium Xanthomonas axonopodis pv. citri, responsible for severe economical damages against the Brazilian citrus industry. As genomic data of this bacterium become available, various resources to analyze its biology have been used to investigate aspects of its pathogenicity and virulence, by using strategies regarding the study of gene expression and the resulting proteins themselves. The main resources used to study its genes are the mutagenesis, real-time quantitative PCR (RT-qPCR), cDNA arrays and bidimensional electrophoresis (2-D), which can be used simultaneously. Thus, a number of aspects related to its capacity to cause the disease have been identified and allowed to better characterize the ability of the bacterium to use its genes during the infection of citrus tissues.